保溫杯較不建議拿來裝汽水、可樂等碳酸飲料，一是因為碳酸飲料的酸性，不適合長時間與保溫杯的不銹鋼內膽接觸；二則是因為碳酸飲料封閉在保溫杯中，容易因為壓力過大釋出二氧化碳，打開杯蓋時飲料會噴濺出來，千萬要小心。
營養師提醒，民眾不論是採用講求“方便”的免洗紙杯、塑膠杯，或是強調“環保”的保溫杯，千萬別把“毒”喝進肚子裡，除不要將保溫杯拿來裝熱牛奶外，更要謹記5錦囊，遠離毒素入肚。
市場各種裝盛飲料、飲品的容器或杯子，都有其使用的限制或條件，不銹鋼保溫杯算是目前多種材質的杯子中，比較穩定，而且可以盛裝的溫度及酸鹼範圍較大的一種杯子。
一般而言，保溫杯能維持飲品高溫的時間較長，所以如果用來泡茶或裝茶，茶葉或茶水長時間浸泡在高溫的水中，就像持續用溫火煮一樣，會使茶中的單寧酸、茶礆大量釋出，影響茶的風味，並且造成營養素的破壞。
所以盛裝在不銹鋼杯中的飲品，建議應儘快喝完，不建議將過熱、過酸，甚至含藥成分的飲品長時間封閉在保溫杯中，以免飲品中某些物質與不銹鋼的長時間接觸，會增加化學物質釋出的風險，且保溫杯也較不建議拿來裝熱牛奶，因為這會讓牛奶中的微生物快速繁殖，造成牛奶酸敗，不慎飲用會引起腹瀉、腹痛，殘留在保溫杯中的牛奶氣味也很難清除乾淨。
如何使用不銹鋼保溫杯或免洗紙杯，才不會吃進有毒物質？以下有5要點供參考：
1) 保溫杯新品使用：
要用中性清潔劑或開水燙洗乾淨，以去除瓶身及內膽表面殘留之金屬或化學物質。即使不銹鋼為穩定的材質，但仍建議不要將滾燙的飲品倒入保溫杯，最好等稍涼，溫度低於80℃後，再倒入不銹鋼保溫杯保溫；或是滾燙的熱飲倒入保溫杯後，待溫度稍涼，再蓋上杯蓋。
2) 保溫杯清洗原則：
可用食品級檸檬酸清除內膽的茶垢或汙漬，或用中性清潔劑洗刷內膽的髒汙。清洗保溫杯的內膽時，請用海綿或軟毛刷清洗，避免用鋼絲刷刷洗，以免刮傷表層，造成與食物接觸時起化學反應，毒性物質容易釋出。
3) 保溫杯殘存異味：
可能表示不銹鋼合金結構已經受損，這就使得溶出金屬化合物的機率增加，此時就建議更換新的保溫杯。
4) 免洗紙杯使用前：
最好少裝含油的食物，以減少塑化劑溶出的機率。在無法確認免洗紙杯的淋膜材質時，最好能自備不銹鋼杯、玻璃杯或磁杯來盛裝滾燙的咖啡、熱茶或豆漿等飲品，以免吃進塑膠毒素。
5) 正確用免洗紙杯：
避免將免洗紙杯放進微波爐或烤箱加熱，以免溫度過高，淋膜材質釋出有毒物質。可詢問店家或觀察免洗紙杯包裝外袋或外箱的說明，確認其耐熱溫度，盛裝合宜溫度的飲料或食物。
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