1.自然轉陰慢性乙肝病毒攜帶者(含慢性乙肝患者)乙肝病毒指標自然陰轉的情況肯定存在，但並不普遍。我國的權威資料調查顯示：HBsAg的年陰轉率在2%左右，一般來說母嬰垂直傳播的攜帶者一般低於2％，18歲以後的青壯年慢性HBV感染者的HBsAg陰轉率在1.5％～3.4％，但乙肝“大三陽”者更難轉陰；HBeAg的年陰轉率(即乙肝“大三陽”轉為“小三陽”)在6.3%～14%。陰轉率的個體差異較大，影響陰轉率高低的主要因素歸納起來有以下五點：
（1）機體的免疫功能因素：機體免疫功能低下，免疫識別能力低下，無法識別並清除體內的HBV，出現所謂“免疫耐受”狀態，乙肝病毒長期佔據肝組織，並不斷複製病毒。
（2）年齡因素：自幼感染HBV，由於機體免疫防衛功能尚不健全，病毒一旦入侵，往往長驅直入，紮根於肝臟，HBVDNA與感染的肝細胞基因整合，血清中的HBsAg持續陽性，日後多年，病毒已是頑固不化，若再想清除，就十分困難了。 隨著患者年齡的增長，乙肝病程將經歷免疫耐受—免疫活動清除—免疫恢復3個階段，這三個自然階段可歷時數十年，直到最後一個階段，病毒指標可能出現持續長久的陰轉。有關資料顯示，70歲以上的老年人乙肝表面抗原(HBsAg)陽性率就極低，80歲以上的老年人幾乎沒有表面抗原陽性者。
（3）遺傳基因因素：雖然乙肝病毒感染的遺傳基因因素尚無定論，但我國慢性乙肝發生與家族血緣因素密不可分，乙肝的家族聚集性十分突出和明顯，乙肝往往呈明顯垂直傳播傾向，乙肝代代相傳與種族和遺傳多態性密切相關，遺傳基因的常染色體隱性遺傳控制點決定了乙肝的易感性和攜帶病毒的長期性。
（4）乙肝病毒的複製狀態因素：如果乙肝病毒處於高複製階段，一般都為乙肝“大三陽”，HBVDNA呈陽性，在這種狀態下，HBV的自然轉陰率就極低。
（5）病毒變異因素：HBV是一種變異發生率較高的病毒，為了適應機體不斷變化的環境和逃逸、躲避治療藥物的打擊，乙肝病毒就產生基因變異，這種基因變異可能發生在乙肝病毒基因片段的多個部位，變異後的HBV更富有欺騙性和頑固性。乙肝病毒變異往往是病情加重、肝硬化甚至肝癌發生的直接因素。
由於乙肝病毒感染者往往具有一個相同的自然過程，如果想要打破這一自然過程，改變乙肝的發展歸宿，提早進行抗病毒治療是十分必要的。但是目前的種種抗病毒藥物，如干擾素、核苷(酸)類似物(拉米夫定、阿德福韋酯、恩替卡韋等)，對於HBV的複製具有一定的抑制作用，但尚不能徹底清除病毒。這就使得乙肝抗病毒治療只能起到部分有效的結果，根治乙肝尚難以實現。因此，HBV的自然陰轉和治療後陰轉的概率都不高，使眾多乙肝患者長期攜帶，乃至終身攜帶乙肝病毒的情況比較普遍。
2.持續穩定的終身攜帶有相當一部分HBsAg攜帶者終身攜帶HBsAg，但最終死於非肝性疾病。曾有人報道218例非活動性HBsAg攜帶者中，有78.2%的肝臟有不同程度的病理變化，可能這種變化就是相對穩定的一種乙肝病毒持續感染的低反應狀態，在我國這種狀況十分普遍。有人稱這是人體免疫系統與乙肝低水平病毒的“和平共處”、“長期共存”的現象。
3.急性發作有一部分HBsAg攜帶者在乙肝病毒攜帶過程中出現肝功能異常，發生急性肝炎。其中乙肝表面抗原(HBsAg)與乙肝e抗原(HBeAg)持續陽性者易發展成慢性乙肝。還有少數人與丁型肝炎病毒重疊感染。個別還不能排除其他病毒引起的肝損傷。從目前的乙肝發病情況看，急性發病者(以往沒有明確的肝病史，平常身體良好，突然出現乏力、食慾缺乏、噁心、嘔吐、眼黃、小便黃、皮膚黃等症狀，去正規醫院就診，經血清化驗檢查出現轉氨酶、膽紅素升高，乙肝病毒指標陽性)，絕大多數並非真正的急性乙肝，而是慢性乙肝病毒感染(或慢性乙肝)的急性發作。其特點是患者早就感染了乙肝病毒，並長期攜帶，乙肝病毒處於“潛伏”狀態，到了一定時期，機體免疫功能發生改變或是HBV攜帶者由於酗酒、勞累、感染其他病毒等誘因，導致急性發病。
（1）判斷HBV攜帶者急性發作的依據：一般而言可從以下幾個方面作出分析判斷：①既往體檢曾經發現過乙肝表面抗原陽性；②有明確的肝病家族史，其母親或父親為乙肝患者；③查體可能發現肝掌或蜘蛛痣等陽性體徵；④B超等檢查提示慢性肝損傷；⑤肝功能檢查轉氨酶或膽紅素急劇升高，肝功能系列中以ALT、AST、球蛋白相對升高明顯；⑥肝穿刺組織學檢查提示慢性肝損傷；⑦抗HBcIgG滴度明顯升高(急性乙肝患者大多數是抗HBcIgM滴度升高，兩者可依此而區別)。
（2）慢性乙肝病毒攜帶者(或慢性乙肝)急性發作的主要原因：一般而言有以下幾個方面：①疊加其他類型的肝炎病毒，如甲型、戊型、丙型或丁型肝炎病毒；②不良的生活方式，如酗酒、徹夜勞累、縱慾狂歡，乙肝病毒變異等。
（3）慢性HBV攜帶者(或慢性乙肝)急性發作的預後，大致有以下幾種情況：①大部分患者經過正確(規範化和個體化治療相結合)的治療和適當的休息，可以達到臨床治癒，個別甚至徹底治癒；②極少部分(1％～2%)患者會發生重型乙肝，也稱暴發性肝壞死，病情危重，肝細胞廣泛壞死，出現昏迷、腹水、出血等嚴重併發症，此型肝炎必須爭分奪秒救治。在我40多年患乙肝的病友中，目睹發生過這類病例有2例，都是慢性乙肝急性發作，肝細胞廣泛壞死而喪命，從發病至死亡都在3～5天；③多數患者經過正規治療，適當休息，病情恢復平穩，再次回到乙肝病毒攜帶狀態。
4.慢性化惡變個別非活動性HBsAg攜帶者可演變為慢性輕、中、重度肝炎及重型肝炎、肝硬化，甚至肝癌。已發生肝硬化的患者中的9.9％～16.6％有發生肝癌的危險。研究表明，非活動性HBsAg攜帶者比非攜帶者發生原發性肝細胞癌的危險概率大。演變為肝癌的關鍵是乙肝表面抗原陽性者的HBVDNA的基因序列是否已經整合到該攜帶者的肝細胞核中。
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