根據《財政部、國家稅務總局關於進一步明確全面推開營改增試點有關勞務派遣服務、收費公路通行費抵扣等政策的通知》（財稅〔2016〕47號）的規定：
一般納稅人提供勞務派遣服務，可以全額按照一般計稅方法依6%的稅率計稅，也可以差額按照簡易計稅方法依5%的徵收率計稅。
小規模納稅人提供勞務派遣服務，可以全額按照簡易計稅方法依3%的徵收率計稅，也可以差額按照簡易計稅方法依5%的徵收率計稅。
其中的差額扣除部分，是指納稅人代用工單位支付給勞務派遣員工的工資、福利和為其辦理社會保險及住房公積金，此部分費用，不得開具增值稅專用發票，可以開具普通發票。
發票的開具，可以分為兩種情況：
1、如果購買方需要的是普通發票，銷售方直接按照6%的稅率或者3%的徵收率全額開具普票即可，這種情況下，票面稅率、金額、稅額呈比例關係，稅率欄顯示6%或者3%。
根據上述政策，納稅人可以選擇全額計稅，即直接根據發票顯示的稅額申報納稅；也可以選擇差額計稅。
納稅人如果選擇差額計稅，是通過在增值稅納稅申報表的相關欄次（一般納稅人填報附列資料三，小規模納稅人填報附列資料）填報差額扣除部分，實現差額計稅的。
也就是說，這種情況下，勞務派遣發票票面的稅額並不是銷售方實際繳納的稅額。
普通發票不適用差額開票功能。
2、如果購買方需要的是專用發票，又有三種方式：
一是銷售方直接按照6%的稅率或者3%的徵收率全額開具或代開專票，這種情況下，票面稅率、金額、稅額呈比例關係，稅率欄顯示6%或者3%。
但是，全額開具專票，也就意味著必須要全額繳納增值稅，發票票面稅額就等於納稅人實際繳納的稅額，不得再進行差額扣除。
這種情況較為少見。
二是銷售方通過新系統中差額徵稅開票功能，錄入含稅銷售額和扣除額，系統自動計算稅額和不含稅金額，備註欄自動打印「差額徵稅」字樣。
這種情況下，票面稅率、金額、稅額沒有比例關係，稅率欄顯示「***」，稅額欄顯示的金額=（票面價稅合計數-備註欄差額扣除額）÷（1+5%）×5%。
上圖中的20元，既是銷售方當期的應納稅額，又是購買方可以憑票抵扣的進項稅額。
三是一筆業務開兩張發票，一張普票和一張專票。
普票對應的含稅銷售額是差額扣除部分，按照6%的稅率或者3%的徵收率開具。假定上例中銷售方為一般納稅人：
專票對應的含稅銷售額是總收款與差額扣除部分之差，按照5%的徵收率開具。
後兩種開票方法，在進行納稅申報時都需要填報納稅申報表差額扣除相關欄次。
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