第一名：新疆大學。新疆大學是全國重點大學，是國家“211工程”建設高校、國家西部大開發重點建設高校、國家教育部與新疆維吾爾自治區人民政府共建高校。現有哲學、經濟學、法學、文學、歷史學、理學、工學、管理學、藝術學九個學科門類。
第二名：石河子大學。石河子大學是國家“211工程”重點建設高校和國家西部重點建設高校，現由教育部和新疆生產建設兵團共建，是“中西部高校綜合實力提升工程”（一省一校）入選高校。學校現有經濟、法、教育、文、歷史、理、工、農、醫、管理、藝術等11大學科門類。
第三名：新疆醫科大學。新疆醫科大學坐落於新疆維吾爾自治區首府烏魯木齊市風景秀麗的鯉魚山下，是一所具有光榮傳統的高等醫學院校，其前身新疆醫學院始建於1954年，1956年建成招生。新疆醫學院的興建，受到了毛澤東、周恩來、朱德等中央領導人的親切關懷和大力支持，毛澤東主席親自決策將新疆醫學院的建設納入“一五計劃”156個重點項目。目前，學校共開設23個本科專業，2個專科專業。
第四名：新疆農業大學.新疆農業大學是自治區重點建設的一所農業高等院校，前身為八一農學院，1995年4月21日經原國家教委批准，更名為新疆農業大學。學校先後獲得“全國五一勞動獎狀”“全國廠務公開先進單位”“開發建設新疆獎狀”榮譽。2006年本科教學工作水平評估優秀。2014年，國家林業局和自治區人民政府攜手共建新疆農業大學。經過64年的勤奮耕耘， 學校現已發展成為一所涵蓋農、理、工、經、管、文、法等七個學科門類。
第五：新疆師範大學。新疆師範大學創立於1978年12月，其前身是烏魯木齊市第一師範學校和新疆教師培訓部。學校現有三個校區，分別是烏魯木齊市沙依巴克區新醫路102號崑崙校區、新市區喀什東路16號文光校區和水磨溝區觀景路100號溫泉校區，碩士及本專科專業覆蓋了哲學、經濟學、法學、教育學、文學、歷史學、理學、工學、管理學、藝術學10個學科門類。
