5月10日，國際學術期刊《分子細胞生物學雜誌》（J Mol Cell Biol）在線發表了中國科學院生物化學與細胞生物學研究所張永蓮研究組的最新研究成果：A sequence of 28S rRNA-derived small RNAs is enriched in mature sperm and various somatic tissues and possibly associates with inflammation。
近年來，除了miRNAs和piRNAs，其他種類的小非編碼（sncRNAs）被不斷髮現，例如來源於tRNA的tsRNAs。rRNA作為細胞中另一種重要housekeeping RNA，是否也能產生類似tsRNAs的小RNA？目前仍缺乏深入研究。在研究員張永蓮和副研究員周玉傳的指導下，助理研究員儲辰、餘璐等人對小鼠精子中的小非編碼RNA進行深入研究，發現一個來源於28S rRNA，序列特點上與已知tsRNAs十分相似的sncRNA（rsRNA-28S）。進一步研究發現，小鼠現有基因組數據中並不包含rsRNA-28S所對應的DNA序列信息，在前人利用RNA-seq對小鼠精子小RNA的研究中，常規的genome mapping方式對測序數據進行處理時將rsRNA-28S誤認為無法mapping的垃圾序列而丟棄。通過定量實驗，研究人員發現rsRNA-28S在小鼠精子中的丰度甚至高於已知的tsRNAs，同時其還在多個體細胞中存在表達。體細胞的rsRNA-28S能響應LPS刺激發生表達改變，而對數十例人精子樣品的篩查發現，生殖道炎症病人白細胞增多症精子中的rsRNA-28S發生了顯著變化。這項研究發現了一個和已知tsRNAs十分類似的rsRNA，揭示了現有genome mapping方法在小RNA測序分析中的不足，並探索了rsRNA-28S的功能。這些結果提示細胞中可能存在一類“housekeeping RNA-derived”小RNAs，而並非僅僅是來自tRNA的tsRNA。
該研究工作得到了研究員陳德桂、劉默芳、王紅豔，上海市計劃生育研究所研究員施惠娟以及法國Clermont Université教授Joël R. Drevet的大力協助，並得到了國家自然科學基金委、科技部的研究經費資助及生化與細胞所分子生物學技術平臺的支持。（來源：中科院上海生命科學研究院）
圖：白細胞增多症病人與正常人精子中的rsRNA-28S有顯著差異。相比正常精子，白細胞增多症病人精子rsRNA-28S的Upper band顯著缺失，這或能作為一種新的臨床精子檢測Marker。
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