2003年SARS流行，王建3次進入首例疑似病人病房；2005年至2009年，人感染禽流感和麻疹疫情相繼暴發，王建多次深入疫區，指導防疫工作；2009年，甲流在部分高校暴發，王建又是第一時間率領應急小分隊進駐校區，制定緊急處理方案……重大疫情現場，王建總是第一時間出現。
王建1983年大學畢業，至今30多年，一直堅守在疾病預防控制第一線，刻苦鑽研、兢兢業業，他組織實施的防治人感染禽流感程序已成為全省人感染禽流感疫情防控工作的樣本；他組織研究的社區防艾考核體系受到美國蓋茨基金會負責人的高度讚譽，此項舉措被建議在全國推廣；2009年，他負責的大冬會冬季賽事疾病防控工作和磨盤山庫底衛生清理工作，填補了我國相關工作空白，得到了國家有關部門高度評價；2015年，市疾病預防控制中心規範有效地處理了10起疑似MERS疫情，王建組織、參與、指導了整個過程。
在處理重大突發公共衛生事件中，王建既是專家又是領導者，他帶領的團隊多次得到省、市衛生計生委的高度評價。
戰鬥在疫情防控第一線，王建絲毫不敢懈怠，工作30多年，他從未休過一天年假。每天他都幾乎第一個到單位上班，最晚一個離開單位。在為市疾控中心培養業務骨幹方面，他將自己多年積累的專業技術傳授給青年職工，並積極組織開展對年輕人的業務培訓，親自為青年職工授課。
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