根據哥斯拉獨立系列故事背景，基多拉原本是來自外星的怪獸，是宇宙怪獸（動漫哥斯拉里基多拉是來自另一個宇宙的生物，為次元怪獸），在哥斯拉稱霸地球時來到地球，並和哥斯拉爭霸地球霸主之位，但最終失敗被打成重傷沉眠於海底，經歷時代變更，山海位移，基多拉所處海域逐漸成為極地，當然，也有可能是基多拉隨海洋變動而位移到極地被冰凍起來。

這個在電影中壁畫上有交代，基多拉與哥斯拉並不是第一次交手，根據壁畫上的描述，大概可以猜測，在很久以前，基多拉曾經被哥斯拉打敗過，並且失敗之後一直被冰封在南極，直到《哥斯拉2》才被喚醒！

在電影中，人類利用潛艇在海里發現了一處水下遺址，這個遺址已經沉入大海，經歷了滄海桑田，時間到底有多久無從考證，但從壁畫上看，哥斯拉，基多拉，魔斯拉都出現過，按照基多拉與哥斯拉的水火不容，兩者肯定有過爭鬥，但哥斯拉有魔斯拉這個強力助手，基多拉不是對手，被哥斯拉打成重傷，這個傷勢嚴重到需要休眠來恢復，基多拉想要逃走，拼命之下，哥斯拉也攔不住，之後基多拉就在地球上找了一個隱蔽的地方休眠，不過時間太久，說不定當時基多拉休眠的時候是在一塊陸地上，不過後來滄海桑田，基多拉被冰封在南極的冰川之中。

基多拉被冰封在南極，在電影中來看，人類在旁邊製造了各種各樣的基地，說明基多拉早已被發現有一段時間，然後這基多拉就被艾瑪博士利用生物電波喚醒。

根據基多拉的設定背景有幾種，但多數設定都是基多拉來自外星，在第四代基多拉的背景中，並非地球土生土長的怪獸，生存時間超過了兩億年之久，在1.3億年前曾經襲擊過地球，那個時候是中生代白堊紀時期，地球上基本上是恐龍的天下，恐龍也因此滅絕，但這個時候的基多拉被魔斯拉消滅了！基多拉存在的版本比較多。

不過電影《哥斯拉2》裡面的基多拉，是傳奇影業最新設定的怪獸王者，按照故事原型設定，基多拉與哥斯拉在遠古時期曾經有過一戰。

基多拉不敵，沉睡南極，後來被冰封，電影中對基多拉的描述是：“一條從星辰降臨的巨龍，它帶來風暴與災難”，這久證明基多拉在遠古時期是來自宇宙中的巨獸。

基多拉的可怕之處，它有三個頭顱，這三個頭顱雖然以中間為主導，但其他兩個，都有一定的認知能力，甚至有獨立意識，基多拉被喚醒之後，又再一次給地球帶來災難。

但哥斯拉在基多拉出現之後，也出來與基多拉大戰了一次，甚至把基多拉的一顆頭顱都咬掉了！這個時候的基多拉剛剛甦醒，感覺還沒有緩過神來，如果不是人類亂搗亂，說不定哥斯拉會讓基多拉再一次沉睡，結果人類把哥斯拉給打傷了！哥斯拉心裡應該非常鬱悶，好心好意幫你們，但你們居然打我？

不過電影的最後，基多拉還是失敗了！再一次基多拉失敗得很徹底，紅蓮模式的哥斯拉，不僅把基多拉給踩爆，大招原子吐息直接把基多拉融化，這一次，基多拉想要休眠冰封也不可能了！不過電影的最後彩蛋，還有留下了基多拉的一顆頭顱，按照基多拉再生能力，估計基多拉會重出江湖，變成機械基多拉也說不定！

當然，下一部電影是《金剛大戰哥斯拉》，嗯！只有金剛與哥斯拉大戰難免有些枯燥，應該會與《蝙蝠俠大戰超人》一樣，蝙蝠俠與超人打了一會兒，之後出現大反派毀滅日，那是不是金剛大戰哥斯拉之後，金剛與哥斯拉聯手大戰王者歸來的基多拉呢？

在遠古時代兩者打鬥過一次，兩敗俱傷了，基多拉被冰封南極，哥斯拉沉睡大海，估計他們都認為對方已經死了，沒看電影裡他倆一見面就罵起來了嗎？

基多拉：挖槽，你他媽還沒死？

哥斯拉：草泥馬，你都沒死老子當然不會死。

基多拉：狗幣，別廢話了，見真章吧

哥斯拉：癟犢子，這次讓你變成太平間硬人兒

沒看過科幻片